По совету сделал дамп на обоих серверах, в момент проблем наблюдается такая картина: https://imgur.com/a/Y9xN0H1 Множественных ретрансмиссий не вижу. На обоих серверах сейчас backlog=65535 reuseport. Posted at Nginx Forum: https://forum.nginx.org/read.php?21,283083,283120#msg-283120