с PAM проблема не имеет ничего общего. Правка limits.conf потожет только если nginx запускать через runuser/su. В rhel для установок ulimit - изучать /etc/sysconfig/. В иных дистрибутивах - править init/rc-скрипты. > Это он пишет про лимит на max open files. > ulimit -n > рихтуй в /etc/security/limits.conf