Отписываюсь. Проблема решена установкой нжинкс версии nginx-1.9.9. Правда после этого наблюдались странные затыки по логам - они и не писались и место занимаемое файлами росло. После перезагрузки все стабилизировалось. Posted at Nginx Forum: https://forum.nginx.org/read.php?21,263791,263962#msg-263962