Такое впечетление, что есть какой-то буфер 4096+, который нужно заполнить, иначе чанк просто не отдается даже при сбросе буффера в php. Может это какой-то буфер в пхп или нжинксе? Posted at Nginx Forum: http://forum.nginx.org/read.php?21,244400,244401#msg-244401